Решение:

Делается с использованием aspnet_compiler.exe
Путь: C:\Windows\Microsoft.NET\Framework\v2.0.50727

Использование:

D:\WINDOWS\Microsoft.NET\Framework\v2.0.50727>aspnet_compiler.exe -p E:\Дело\Проекты\ks62\ks62.asp.22july -v /tbh c:\deploy\ks
-p – исходная папка
-v – виртуальная на IIS,а потом выходная папка.

D:\WINDOWS\Microsoft.NET\Framework\v2.0.50727>aspnet_compiler.exe -p E:\Дело\Проекты\ks62\ks62.asp.22july -v /tbh -u -fixednames c:\deploy\ks
-u – позволяет менять разметку(а код будет как ранье в dll)- режим updatable.
-fixednames – чтобы при очередном обновлении система давала одинаковые имена библиотекам(это важно при частичном обновлении)

Аналог всего это Biuld/Publish Web Site(j,zpfnktmyj поставь первые 2 галочки)

Опубликовано в ASP.NET