Web-automation.ru

Решение:
поместить в Див с position:relative; z-index: 5;
правда в ie7 будет все-равно поверх виден блок с заголовка правой колонки – так что его придется удалять для пользовательского интерфейса, а не админского при помощи hideCols

<asp:ModalPopupExtender ID="mpeNewDep" runat="server" 
PopupControlID="pnlNewDep" 
TargetControlID="lnkNewDepFantom" 
BackgroundCssClass="cedepBGModalNewDep" 
CancelControlID="btnCancel2" 
X="20" Y="20" BehaviorID="clientMdlpuUsers">
</asp:ModalPopupExtender> 
<div style=" position:relative; z-index: 5;">

<asp:Panel ID="pnlNewDep" runat="server" CssClass="cedepModalPanelNewDep" ScrollBars="Auto"
onprerender="pnlNewDep_PreRender" > 
<asp:ImageButton ID="btnCancel2" ImageUrl="~/App_Themes/Controls/Catalog/Images/close.png" CssClass="cedepCloseImageButton" runat="server" />
....
</asp:Panel>
</div>